Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Casq1O09165 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Casq1O09165 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms