Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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