Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
EllO08856 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
EllO08856 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
EllO08856 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
EllO08856 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
EllO08856 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
EllO08856 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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EllO08856 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
EllO08856 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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