Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm2035J3QP87 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm2035J3QP87 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm2035J3QP87 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm2035J3QP87 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm2035J3QP87 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm2035J3QP87 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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