Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms