Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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