Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Bbip1J3QMK2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms