Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms