Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms