Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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