Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ankrd50F7BE84 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd50F7BE84 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms