Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28048F7BCN0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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