Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syngap1F6SEU4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms