Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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