Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Brpf1B2RRD7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Brpf1B2RRD7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Brpf1B2RRD7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Brpf1B2RRD7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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