Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zbed5B2RPU8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zbed5B2RPU8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms