Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms