Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AgrnA2ASQ1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms