Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms