Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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