Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17190V9GX38 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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