Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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