Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms