Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms