Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms