Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec2Q9WV35 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms