Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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