Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod4Q9JLH8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms