Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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