Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Mrpl39Q9JKF7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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