Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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