Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kcnn1Q9EQR3 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kcnn1Q9EQR3 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kcnn1Q9EQR3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kcnn1Q9EQR3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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