Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Tlr1Q9EPQ1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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