Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem43Q9DBS1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms