Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SrpraQ9DBG7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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