Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms