Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms