Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39lQ9DB16 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cab39lQ9DB16 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cab39lQ9DB16 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39lQ9DB16 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms