Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Alkbh4Q9D8F1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms