Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms