Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms