Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms