Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms