Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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