Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms