Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms