Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms