Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms