Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cnot11Q9CWN7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cnot11Q9CWN7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cnot11Q9CWN7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cnot11Q9CWN7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cnot11Q9CWN7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cnot11Q9CWN7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot11Q9CWN7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cnot11Q9CWN7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cnot11Q9CWN7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cnot11Q9CWN7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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