Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Pfdn1Q9CWM4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Pfdn1Q9CWM4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Pfdn1Q9CWM4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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